二代稻纵卷叶螟是水稻一生中发生数量最高、危害最重的一代，须重点防治。稻纵卷叶螟的防治应以农业防治为基础，合理使用农药，协调化学防治与保护利用自然天敌的矛盾，将幼虫的危害控制在经济允许水平之下。
（1）农业防治：
     ①选用抗（耐）虫的良种，在高产、优质的前提下，应选择叶片厚硬、主脉紧实的品种类型，使低龄幼虫卷叶困难，成活率低，达到减轻危害的目的。
    ②合理施肥，防止前期猛发旺长，后期贪青迟熟，促使水稻生长发育健壮、整齐，适期成熟，提高水稻本身的耐虫能力，以缩短危害期。
    ③科学管水，适当调节搁田时期，降低幼虫孵化期的田间湿度，或在化蛹高峰期灌深水2～3天，防治效果都好。
    ④消灭越冬虫源，在冬季和早春结合积肥、治螟，清除田块内的稻桩以及田边的杂草，沤制堆肥，以消灭越冬虫源。 （2）生物防治：
    ①保护自然天敌，在调查的基础上，协调药剂防治时间、药剂种类和施药方法。如按常规时间用药，对天敌杀伤大时，应提早或推迟施药；如虫量虽已达到防治指标，但天敌寄生率很高，也可不用药防治。在选择施药种类和施药方法时，还应尽量注意采用不杀伤或少杀伤天敌的种类和方法以保护自然天敌。
    ②释放赤眼蜂，从发蛾始盛期开始到蛾量自高峰下降后为止，每隔2～3天释放一次，连放3～5次。放蜂量根据稻纵卷叶螟的卵量而定，每丛有卵5粒以下，每次每亩放1万头左右；每丛有卵10粒左右，每次每亩放3万～5万头。
    ③以菌治虫：施用生物农药杀螟杆菌、青虫菌或苏云金杆菌HD-1菌剂（每克菌粉含活孢子100亿以上），每亩用150～200克，加0.1％洗衣粉或茶子饼粉作湿润村，兑水60～75千克喷雾，若再加入少量化学农药（约为农药常用量的5％），则可提高防治效果。
（3）药剂防治：
    水稻分蘖期和长穗期易受稻纵卷叶螟危害，尤其是长穗期损失更大。要在发生的主害代二龄幼虫盛期（即大量叶尖被卷时期），使用药剂防治较为恰当，尤其是一些生长嫩绿的稻田，更应作为防治对象田。药剂防治应狠治水稻长穗期危害世代，不放松分蘖期危害严重的世代，采取“狠治二代、巧治三代、挑治四代”的综防措施，一般年份防治只需施药一次，即可达到消灾保产的目的。三、四代幼虫视发生情况结合其他病虫兼治。幼虫三龄前是药剂防治的最好时机。一般傍晚及早晨露水未干时施药的效果较好，晚间施药效果更好，阴天和细雨天全天均可施用。在防治失时或漏治、幼虫已达四至五龄的情况下，选用触杀性较强的药剂及时补治。在施药前先用竹帚猛扫虫苞，使虫苞散开，促使幼虫受惊外出，然后施药，可提高防治效果。施药期间应灌浅水3～6厘米左右，保持3～4天。如在搁田或已播绿肥不能灌水时，药液应适当增加。